À l'origine, le CCRP était le conférence canadien de la recherche sur les pêches et a été formé pour assumer certaines des fonctions du comité national sur la pisciculture, qui était un comité mixte du conseil national de recherches et de l'office de biologie du Canada (rebaptisé l'office de recherche sur les pêches de Canada en 1938). La première réunion du CCRP, parrainée par le CNRC, a eu lieu à Ottawa le 6 janvier 1948, et son mandat stipulait que le CCRP « agissait comme centre d'échange d'information et comme forum de discussion sur les problèmes communs, pour promouvoir la coordination de la recherche et de la technique, d'examiner quelles recherches doivent être entreprises et de faire des recommandations en conséquence, de donner des conseils sur l'octroi de fonds pour des recherches spécifiques lorsque de tels conseils sont demandés et de donner des conseils sur la diffusion de l'information ». Au départ, il s'agissait d'un forum où les recherches proposées par les scientifiques du gouvernement étaient examinées par la communauté universitaire du Canada. Le CCRP est passé d'un comité à une organisation entièrement dépendante du financement gouvernemental à une organisation autofinancée dont le seul but était de convoquer une conférence par an sur un cycle Est-Centre-Ouest-Centre. Le CCRP a été constitué en 2009 pour protéger les présidents des arrangements locaux de toute responsabilité personnelle et le conseil fondateur du CCFFR a été précis en décidant que l'organisation existait pour convoquer la conférence et qu'elle n'avait pas de politiques ou de procédures et n'a pris aucune position au nom de ses membres.

La société canadienne des limnologues (SCL) a vu le jour lors de la réunion de 1975 de la SIL à l'institut des eaux douces de Winnipeg, répondant à une perception largement répandue selon laquelle les scientifiques canadiens des eaux douces doivent trouver de meilleures façons de communiquer entre eux et de parler d'une voix commune. Les premiers présidents de SCL comprenaient Marcel Ouellet (1979-1981) et Michael Dickman (1981-1984) à l'Université Brock. SCL a d'abord évolué à partir de SIL-Canada qui existait sous la direction de Fred Ward à l'Université du Manitoba et de Diane Malley à l'Institut des eaux douces. SCL a participé pour la première fois à une conférence nationale conjointe en partenariat avec la Conférence canadienne pour la recherche halieutique en 1979, et a participé à des réunions annuelles avec le CCFFR chaque année depuis lors. En 2014, la SCL a tenu une réunion conjointe pour la conférence Genomes to Biome, co-organisée avec la société canadienne d'écologie et d'évolution (SCEE) et la société canadienne de zoologie (SCZ). La SCL a commencé à reconnaître les réalisations de toute une vie en limnologie avec son prix Rigler à partir de 1985, et la réussite des étudiants a commencé à être reconnue avec le prix Peters à partir de 2007. En 2018, la SCL a été constituée au niveau fédéral en tant qu'organisation à but non lucratif et plusieurs membres de son premier conseil d'administration a joué un rôle actif dans la création de SCSA.